Contudo, com a gradual entrada em funcionamento do Sistema Multimunicipal de Saneamento do Algarve, a cargo da AdA, as ETAR Nascente e Poente passaram a ser exploradas passaram por essa entidade a 30 de Setembro de 2006.

As águas residuais produzidas na freguesias de Pechão foram também encaminhadas para a ETAR Poente de Olhão, a 6 de Outubro de 2005, quando se procedeu à desactivação da ETAR de Pechão e à entrada em funcionamento da Estação Elevatória e do sistema interceptor que drenam essas águas residuais.

As freguesias de Moncarapacho e Fuseta foram integradas no Sistema Multimunicipal de Saneamento no dia 11 de Agosto de 2006. As águas residuais produzidas nestas freguesias foram encaminhadas para a ETAR Nascente de Olhão através de diversas estações elevatórias construídas para o efeito, as quais são também da responsabilidade da AdA.

Existem ainda algumas ETAR compactas em urbanizações onde ainda não existe rede pública de saneamento: Urbanização da Murteira de Baixo (Moncarapacho), Urbanização Cerro Azul (Moncarapacho/Quelfes),  Urbanização Monte de São Miguel (Quelfes) e Urbanização da Quinta da Palmeira (Quelfes).

Contudo, das anteriormente referidas a única ETAR compacta a cargo do Município é a da  Urbanização da Murteira de Baixo, estando as restantes a cargo dos respectivos loteadores, nomeadamente no que diz respeito à da Urbanização do Cerro Azul que está em processo de licenciamento pela CCDR - Algarve para posterior recepção pelo Município.

Para além das ETAR o Município tem também a seu cargo duas pequenas Estações Elevatórias de Saneamento (EE): EE da Nova Zona Empresarial de Marim e EE da Fuseta.